AMRmap - онлайн платформа анализа данных резистентности к антимикробным препаратам в России, которая содержит набор инструментов для визуализации данных о чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам и распространенности основных генетических детерминант устойчивости к антибиотикам.
Для цитирования: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2017. – Т.19, №2. – С. 84-90.
База данных AMRmap включает регулярно пополняемые и обновляемые данные, накапливаемые в рамках проспективных многоцентовых эпидемиологических исследований антибиотикорезистентности, проводимых НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) и Межрегиональной ассоциацией по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ). В настоящее время база данных содержит информацию о антибиотикочувствительности >40000 клинических изолятов микроорганизмов, выделенных в 52 городах РФ в 1997-2016 гг., тестирование которых проводилось в центральной лаборатории НИИАХ.
Категории чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам определяются в соответствии с действующими рекомендациями EUCAST и российскими клиническими рекомендациями.
Loading...




Loading...

Loading...
Loading...
Loading...


Loading...
Loading...
Loading...


Loading...
Максимум:

Минимум:

Loading...
Всего попарных отличий:

Точка(и) наблюдения с максимальным количеством отличий:


Loading...
Loading...
Loading...
Loading...
Loading...


В данном разделе все расчеты производятся для Р+УР изолятов.

Число в каждой ячейке означает процент изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП по столбцу, от общего количества изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП по строке.

Loading...

Тренд отражает долю изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП2, от общего количества изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП1.

Loading...
Максимум:

Минимум:

Таблица отржает долю изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП2, от общего количества изолятов, нечувствительных (Р+УР) к АМП1.

Loading...

Loading...
Loading...
Loading...

Loading...
Loading...

На данной вкладке представлена относительная частота выделения изолятов с генетическими детерминантами резистентности по годам. Данные за 2016-2017 гг. находятся в работе.

Согласно данным полученным в рамках исследований НИИАХ и МАКМАХ.

Loading...

Loading...
Loading...
Loading...

Loading...

Скачайте pdf версию руководства пользователя


Скачать руководство



Команда проекта

Разработка

Кузьменков Алексей ЮрьевичАвтор Системы и Ведущий Разработчик
Специалист по анализу данных Межрегиональной ассоциации по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)
Врач-хирург
Трушин Иван ВитальевичРазработчик
Программист, специалист по управлению данными Межрегиональной ассоциации по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)
Авраменко Андрей АлексеевичРазработчик
Программист, специалист по управлению данными Межрегиональной ассоциации по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)

Консультанты

Роман Сергеевич Козлов, профессор, д.м.н.Директор и Главный Эксперт проекта
Член-корреспондент Российской Академии Наук (РАН)
Главный внештатный специалист Минздрава России по клинической микробиологии и антимикробной резистентности
Директор НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Президент Межрегиональной ассоциации по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)
Руководитель сотрудничающего центра ВОЗ по укреплению потенциала в сфере надзора и исследований антимикробной резистентности
Дехнич Андрей Владимирович, к.м.н.
Заместитель Директора НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Эйдельштейн Михаил Владимирович, к.б.н.
Заведующий лабораторией НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
О проекте

logo О проекте


Название

Онлайн платформа анализа данных резистентности к антимикробным препаратам в России

Версия

1.0 от 07.12.2017

Цель

Анализ и визуализация данных антибиотикорезистентности

Ведущие организации

  • Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ).
  • НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России.

Публикации

Постер ECCMID 2017

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2017. – Т.19, №2. – С. 84-90.

Обновления

1.0, 07.12.2017

  • значительно улучшена производительность и стабильность работы;
  • улучшена поддержка мобильных устройств;
  • создан новый раздел "Сравнения";
  • дополнены данные о чувствительности (H. pylori);
  • обновлен дизайн графиков.

0.9.5 beta, 06.10.2017

  • открыт доступ к локальным данным для экспертов;
  • улучшена скорость и стабильность работы;
  • небольшие изменения главной страницы;
  • улучшена поддержка мобильных устройств.

0.9 beta, 28.09.2017

  • добавлена возможность сохранять графики;
  • добавлена возможность сохранения интерактивных карт.

0.8 beta, 12.09.2017

  • создан генератор отчетов docx;
  • ускорена загрузка;
  • усовершенствован файл хранения сессии.

0.7 beta от 14.07.2017

  • разработана система генерации ссылок для воспроизведения результатов анализа;
  • улучшена стабильность работы фильтров.

0.6 beta от 14.06.2017

  • запущена англоязычная версия;
  • улучшена стабильность работы;
  • созданы интерактивные матрицы множественных сравнений;
  • доработана матрица перекрестной устойчивости;
  • создан подраздел "Дерево";
  • добавлена возможность просматривать изменения во времени на интерактивной карте;
  • разработана система сохранения сессии для воспроизведения результатов анализа.

0.5 beta от 16.04.2017

  • расширены картографические возможности;
  • ускорена загрузка;
  • добавлена возможность получения информации о МПК конкретных изолятов;
  • добавлена возможность произвольного агрегирования данных МПК;
  • оптимизирован алгоритм фильтрации АМП;
  • создан подраздел "Рейтинг".

0.4 beta от 28.03.2017

  • улучшена производительность системы;
  • обновлен дизайн.

0.3 beta от 10.03.2017

  • создан раздел анализа молекулярных данных:
    • разработана карта отображающая генетические маркеры устойчивости;
    • интерактивные графики и таблицы:
      • график-пирог генетических маркеров;
      • график доли устойчивых изолятов по всем антибиотикам;
      • график распределения МПК по выбранному антибиотику;
  • доработан раздел перекрестной устойчивости:
    • изменен алгоритм расчета матрицы перекрестной устойчивости;
    • изменен алгоритм расчета графа перекрестной устойчивости;
    • изменен алгоритм расчета тренда перекрестной устойчивости;
  • обновлен дизайн;
  • улучшены базовые алгоритмы расчета.

0.2 beta от 16.11.2016

  • расширены возможности картографического отображения:
    • добавлена возможность отрисовывать контуры;
    • добавлены возможности работы с цветовой палитрой;
  • расширены возможности анализа трендов:
    • определение пиков и спадов трендов;
    • добавлена возможность анализа графов (расположение в пространстве, выбор узлов, задание размеров узлов, определение центральности узла и количества связей);
  • создан раздел анализа перекрестной резистентности:
    • разработана модель графа перекрестной резистентности с дополнительными параметрами (временной период, параметры отображения связей);
    • создан дополнительный табличный вывод по построенному графу;
    • разработана матрица перекрестной резистентности с дендрограммами;
    • разработан тренд перекрестной устойчивости с дополнительным текстовым выводом.

0.1 beta от 01.10.2016

  • переработана структура системы;
  • обновлен дизайн:
    • создан логотип;
    • ликвидирована отдельно существовавшая вкладка Тренды;
    • уход от системы дашбордов;
  • улучшена поддержка мобильных устройств;
  • добавлена вкладка Справка с подразделами:
    • создан подраздел Авторы;
    • создан подраздел Руководство пользователя:
      • создано интерактивное руководство пользователя;
      • создано руководство пользователя в формате pdf;
  • создан подраздел О проекте;
  • создан footer;
  • разработана система уровней доступа пользователей;
  • добавлена возможность выбора ЛПУ;
  • разработан и добавлен график Антибиотики ТОП;
  • доработки вкладки Гистограмма;
  • доработки вкладки Гистограмма + 95% ДИ;
  • переработана вкладка Суммарная информация;
  • переработана вклада Таблица;
  • оптимизирована работа модуля карты:
    • переработано выпадающее меню;
    • оптимизирован автофокус;
  • переработана система вычисления фильтров;
  • улучшена работа генератора отчетов;
  • добавлена Google аналитика;
  • переработана система расчетов ядерной регрессии;
  • переработана система подготовки данных к расчетам;
  • создана и внедрена "концепция расчета 95% ДИ" для оценки точности данных;
  • оптимизирована загрузка данных;
  • оптимизированы вычисления циклов.

Контакты

Кузьменков А.Ю.


IAC IACMAC
Mail to Facebook VK Twitter Instagram